濟寧醫(yī)學院共計開設27個專業(yè)，分別為預防醫(yī)學、臨床醫(yī)學、護理學、藥學、醫(yī)學檢驗、藥物制劑、精神醫(yī)學、病理學與病理生理學、神經(jīng)病學、免疫學、心血管疾病研究診療中心等，具體完整專業(yè)名單見下表。

濟寧醫(yī)學院專業(yè)一覽表

濟寧醫(yī)學院特色重點專業(yè)名單

1、國家級特色專業(yè)（2個）：預防醫(yī)學、臨床醫(yī)學。

2、省級特色專業(yè)（7個）：預防醫(yī)學、臨床醫(yī)學、護理學、藥學、醫(yī)學檢驗、藥物制劑、精神醫(yī)學。

3、山東省省級教學改革試點專業(yè)（1個）：臨床醫(yī)學。

4、山東省重點學科（5個）：病理學與病理生理學、神經(jīng)病學、免疫學、心血管疾病研究診療中心、神經(jīng)內(nèi)科學。